Efter endnu en elendig sommer hjemme hos Dursleys er det endelig tid for Harry Potter at vende tilbage til Hogwarts School of Wizards. Der venter et nyt år med magi uden magi og fantastiske eventyr med sine venner: Den flittige og intelligente pige Hermione Granger og den klodsede, men elskelige dreng Ron Weasley.
Men allerede før Harry kan komme til sin elskede skole, støder han ind i problemer, da den mystiske husalf Dobby forsøger at forhindre ham i at starte den nye periode ved at forhindre Harry i at komme i skole. Da det efter en dramatisk række af begivenheder alligevel lykkes ham at komme til Hogwarts, viser situationen sig at være værre, end han troede. Flere elever på skolen er forstenede én efter én, og ingen ved, hvem eller hvad der gør det.
Og måske det værste og mest akavede af alt: Hele skolen mistænker Harry Potter på grund af hans berygtede status som slangehvisker.
